Barwniki kwasowe mają grupy auksochromatyczne, takie jak grupy hydroksylowe, karboksylowe i sulfonowe, które są naładowane ujemnie w roztworze. Sól złożona z tego pigmentu i jonów Na, K i Ca jest alkaliczna w roztworze. Łączy się z ważnymi składnikami dodatnio naładowanych komórek lub przenika do przestrzeni międzykomórkowej, aby zabarwić cytoplazmę, czerwone krwinki, włókna mięśniowe itp.
